La baie de Malpèque, située sur l'Île-du-Prince-Édouard, est une lagune côtière composée de différents types de zones humides telles que des plans d’eau peu profonds, des zones intertidales et des îles. Les zones intertidales sont dominées par la zostère (Zostera marina) qui abrite une communauté diversifiée d'invertébrés marins et sert de source de nourriture à une grande diversité d'oiseaux d'eau, dont le pluvier siffleur (Charadrius melodus) et la sarcelle à ailes vertes (Anas crecca carolinensis). Il s'agit d'une importante zone de nurserie pour les mollusques et crustacés, comme les huîtres creuses (Crassostrea virginica) de la baie de Malpeque de renommée internationale. Les îles de la lagune sont également des sites de colonie de reproduction pour un grand nombre d'oiseaux marins. La baie accueille la plus grande colonie du grand héron bleu (Ardea herodias) de la province et plus de 1% de la population nord-américaine de cormorans à aigrettes (Nannopterum auritus) en automne. Au printemps et à l'automne, entre 14 000 et 20 000 bernaches du Canada (Branta canadensis) sont également présentes sur le site.