El sitio se localiza en el extremo occidental del territorio brasilero, el “Pantanal” es considerado el área de inundación periódica del continente americano y la convergencia de tres de los más grandes biomas de Sur América: Amazonia, Cerrado y Chaco.  Este constituye un enorme delta en el cual convergen varios ríos provenientes de la planicie. Pantanal Matogrosense presenta una de las más grandes y espectaculares concentraciones de vida silvestre en el Neotrópico y es uno de los humedales más importantes de Sudamérica para las aves acuáticas. Es el hogar de 90 especies de mamíferos, 700 especies de aves, 160 especies de reptiles, 260 especies de peces y 45 especies de anfibios. El sitio es importante para especies vulnerables globalmente como el venado de pantano (Blastocerus dichotomus), el oso hormiguero gigante (Myrmecophaga tridactyla) y el armadillo gigante (Priodontes maximus), así como las nutrias gigantes en peligro de extinción (Pteronura brasilensis). Pantanal Matogrosense también está catalogado como Patrimonio de la Humanidad y Reserva de Biosfera. El turismo incontrolado, la pesca recreacional, la caza de especies en peligro y la deforestación representan serias amenazas para el sitio.